質(zhì)譜級賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶
Lysyl Endopeptidase?
本產(chǎn)品是質(zhì)譜分析前處理時(shí)常用的蛋白分解酶即賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶,該酶可以特異性切除賴氨酸基團(tuán)C末端的多肽,可用于蛋白測序分析和 Lys-X 化合物的酶合成。若同時(shí)使用賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶和胰酶,可更好地切斷賴氨酸基團(tuán)的多肽,增加多肽的數(shù)量。產(chǎn)品已按照使用習(xí)慣做成小包裝,是方便使用的冷凍干燥品。20 μg/支可用于100-200個(gè)樣品的凝膠內(nèi)消化。
來源:細(xì)菌
外觀:凍干粉(包含2 mmol/L Tris-HCl 緩沖液,pH8)
活性:0.03~0.07 AU/vial
分子量:27,000(瓊脂糖過濾),30,000(SDS-PAGE)
溶解性:溶于水或緩沖液
穩(wěn)定性:溶解于 pH 值 5.0-12.0 的 Tris 緩沖液中,可在4℃穩(wěn)定保存2年;在 pH 值 6.0-11.0、30℃時(shí)能穩(wěn)定保存,但溫度超過50℃時(shí)不穩(wěn)定。
最適pH值:9.0~9.5
等電點(diǎn):6.9~7.0
底物特異性:
可水解底物——Tos-Lys-OMe、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA
不可水解底物——Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNA、Arg-pNA
抑制劑:DFP、PMSF、TLCK
◆特點(diǎn)
● 高特異性、高蛋白質(zhì)消化率、適用于蛋白質(zhì)譜分析
● 提高裂解效率、增加肽段數(shù)量
● 根據(jù)使用量特意制備小包裝,方便使用
◆應(yīng)用
分別采用胰蛋白酶(Tp)、賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶(Lys-C)和 Tp與Lys-C 聯(lián)用進(jìn)行膠內(nèi)酶切的效果比較。
牛血清蛋白 BSA 的條帶(100 ng)通過 SDS-PAGE 獲得,然后分別用 Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp 進(jìn)行酶切,再用 MALDI-TOFMS 法進(jìn)行分析。
這些蛋白酶的實(shí)驗(yàn)效果見下表。
表 1:Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp 的結(jié)果對照
這些結(jié)果表明 Lys-C 酶解的漏切位點(diǎn)數(shù)(Missed Cleavage)最少。Tp 酶解時(shí)加入 Lys-C 后,漏切位點(diǎn)數(shù)有所降低,同時(shí),可以鑒定出更多的多肽。
Tp | Lys-C | Lys-C+Tp | |
裂解位點(diǎn) | 精氨酸和賴氨酸的C端 | 賴氨酸的C端 | 精氨酸和賴氨酸的C端 |
漏切位點(diǎn)數(shù) (漏切位點(diǎn)所占比例) | 多(8%) | 很少(0%) | 少(3%) |
鑒定出的多肽數(shù)量 | 17 | 19 | 22 |
胰蛋白酶(Tp)(圖 a)和賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶(Lys-C)+Tp( 圖 b)酶切后的質(zhì)譜結(jié)果對照圖。
Lys-C+Tp 酶切后,可以在 m/z=2000 時(shí)得到吸收峰,而單獨(dú)的 Tp 酶切在 m/z=2000 時(shí)沒有吸收峰。該結(jié)果表明 Lys-C 可以提高測序覆蓋度。
( 數(shù)據(jù)由大阪醫(yī)療中心和婦嬰健康研究所Y. Wada 博士提供 )
賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶
賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶,最初由 Masaki 等人從土壤細(xì)菌中分離得到。該酶可以特異性剪切賴氨酸殘基C末端和S-氨乙基半胱氨酸殘基的肽鍵,用于蛋白測序和 Lys-X 化合物的酶催化合成。該酶穩(wěn)定性高,在4M尿素或 0.1% SDS 溶液中 30℃ 孵育6小時(shí)之后,仍然擁有完整的生物活性。
外觀 | 凍干粉(包含ca. 10% Tris-HCl buffer,pH 8) | 活性 | 見包裝 |
分子量 | 27,000(凝膠過濾);30,000 (SDS-PAGE) | 溶解性 | 易溶于水或緩沖液 |
最佳pH | 9.0-9.5(酰胺酶的最佳活性 pH) | 等電點(diǎn) | 6.9-7.0 |
抑制劑 | DFP、PMSF、TLCK | 來源 | 細(xì)菌 |
穩(wěn)定性 | 溶于pH 值 5.0-12.0 的緩沖液中,可于4℃穩(wěn)定保存。溶于pH 值 6.0-11.0 的緩沖液中,可于30℃穩(wěn) 定保存,但是50℃及以上不穩(wěn)定。 | ||
單位定義 | 一單位酰胺酶(AU)指在30℃ pH 9.5 時(shí)每分鐘產(chǎn)生1 μmol 對硝基苯胺所需的酶量。 | ||
底物特異性 | 水解底物:Tos-Lys-Ome、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA | ||
非水解底物:Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNa、Arg-pNA |
※ 本頁面產(chǎn)品僅供研究用,研究以外不可使用。
產(chǎn)品列表
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 產(chǎn)品等級 | 備注 |
125-05061 | Lysyl Endopeptidase?, MS Grade 賴氨酰肽鏈內(nèi)切酶,MS級 | 20 μg×5 | 質(zhì)譜級 | - |
050-05941 | Endoproteinaseglu C, Sequencinggrade 測序級谷氨酰蛋白內(nèi)切酶Glu-C | 50 μg | 生物化學(xué)分析級 | - |
202-15951 | Trypsin, from Porcine Pancreas, Mass Spectrometrygrade 豬胰腺胰蛋白酶質(zhì)譜級別 | 20 μg×5 | 質(zhì)譜級 | - |